生物学杂志 ›› 2022, Vol. 39 ›› Issue (1): 62-.doi: 10. 3969/ j. issn. 2095-1736. 2022. 01. 062
摘要:
为挖掘乌拉尔甘草钙调磷酸酶B 互作蛋白激酶 (Calcineurin B like protein interacting protein kinase, CIPK)家族成员特征并预测其功能,利用生物信息学方法鉴定乌拉尔甘草CIPK 家族基因,并对其进行系统发育、基因结构、保守结构域及进化关系、表达特征等分析。从乌拉尔甘草基因组中鉴定获得22 个GuCIPK 基因,分布于19 个不同的染色体位置;氨基酸序列比对分析发现多数GuCIPK 都含有1 个Ser/ Thr 结构域、1 个NAF 结构域以及PPI 结构域;进化树分析结果显示,22 个GuCIPK 基因可分为5 个亚组。GuCIPK 基因的上游启动子中存在一些非生物胁迫和激素应答元件,推测GuCIPK 基因的功能发挥可能受不同信号的调控。根据组织特异性表达特征可将GuCIPK 分为Ⅰ~Ⅳ 4 个组,其中 Ⅱ 组中6 个GuCIPK 成员在根、茎和叶片中的表达量较高,Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ组的GuCIPK 成员在根、茎、叶组织中的表达相对较低。利用qRT-PCR 分GuCIPK 响应不同非生物胁迫的表达特征,结果表明:在盐、氧化、干旱、高温和低温胁
迫下,GuCIPK 基因受到不同胁迫的诱导表达。结果为进一步探究GuCIPK 的功能和可能的调控机制提供了一定参考。
中图分类号: